Currículo
Regulação Genética de Eucariotas RGE
Contextos
Groupo: Despacho n.º 4037/2024 > 2º Ciclo > Componente Curricular > UCs Optativas > Grupo Opção I
ECTS
4.0 (para cálculo da média)
Objectivos
Com a frequência desta unidade curricular, os estudantes deverão ser capazes de explicar os principais mecanismos de regulação da expressão génica em eucariotas, analisar o papel dos fatores de transcrição e de elementos reguladores como alvos terapêuticos, e discutir a influência da cromatina e das modificações epigenéticas na expressão génica. Deverão igualmente ser capazes de avaliar a contribuição dos mecanismos epigenéticos para processos fisiológicos e em contexto de doença, interpretar o papel funcional dos RNAs não codificantes na regulação da expressão génica e aplicar técnicas genómicas e transcriptómicas ao estudo da regulação genética. Por fim, pretende-se que os estudantes desenvolvam pensamento crítico e competências de análise na leitura e discussão de literatura científica especializada.
Programa
A unidade curricular aborda os mecanismos moleculares que regulam a expressão génica em eucariotas, com ênfase nos processos de transcrição, controlo pós-transcricional e mecanismos epigenéticos. Será explorado o papel dos fatores de transcrição e de elementos reguladores específicos, com destaque para a sua utilização como alvos terapêuticos. Aborda ainda o papel das modificações epigenéticas (metilação do DNA, modificações das histonas, remodelação da cromatina) na estrutra da cromatina e acessibilidade do DNA à maquinaria de transcrição, e o respetivo impacto na regulação da expressão génica. Será discutida a contribuição de mecanismos epigenéticos para processos fisiológicos e em contextos patológicos, como cancro, doenças neurodegenerativas ou doenças metabólicas. Serão também abordados os mecanismos de regulação mediados por RNAs não codificantes, como miRNAs, lncRNAs e siRNAs. A disciplina inclui ainda a introdução a técnicas genómicas e transcriptómicas, como RNA-seq, ChIP-seq e ATAC-seq, aplicadas ao estudo da regulação da expressão e da organização funcional do genoma.
Método de Avaliação
Os temas apresentados nas aulas teóricas abordam o estado actual do conhecimento da regulação genética de eucariotas, aspectos teóricos da metodologia e questões mais amplas sobre estratégias de investigação experimental dos mecanismos moleculares da regulação da expressão genética. As aulas teóricas serão intercaladas com momentos activos de promoção de discussão e/ou reflexão, por parte dos alunos, sobre os temas abordados. As aulas práticas têm como objectivo proporcionar ao aluno a discussão crítica dos conhecimentos teóricos adquiridos, com recurso a seminários bem como a resolução de exercícios e/ou casos de estudo, o que lhe permitirá enquadrar o conhecimento adquirido nas mais diversas aplicações. A componente laboratorial inclui a realização de experiências e técnicas de biologia molecular no âmbito do conteúdo programático, nomeadamente: análise FAIRE para a identificação de regiões da cromatina que estão acessíveis, ensaios de transfecção/transactivação, transcrição reversa e PCR em tempo real. A componente laboratorial incluirá também uma sessão de “dry lab” onde será realizada uma análise bioinformática de dados de RNA-seq disponíveis em bases de dados públicas. A avaliação será centrada na avaliação contínua de acordo com a participação nos diferentes momentos da disciplina (teóricos, práticos e laboratoriais), na realização de exercícios e/ou casos de estudo nas aulas práticas e um trabalho final, que poderá consistir na apresentação e discussão de um artigo científico, num relatório de uma actividade labpratorial ou uma pequena monografia sobre um tema selecionado pelo aluno.
Carga Horária
Carga Horária de Contacto -
Trabalho Autónomo - 82.0
Carga Total -
Bibliografia
Principal
- Molecular Cell Biology, 9th Ed. Macmillan. New York, 2021.: Lodish H., Berk A., Kaiser C.A. 2021
- Molecular Biology of the Cell: Alberts B., Johnson A., Lewis J., Raff M., Roberts K., Watson J., 2015 6th Ed., W.W. Norton & Company, NY. 2015.
- Lewin’s Genes XII,: Jocelyn E. Krebs, Elliott S. Goldstein, Stephen T. Kilpatrick, 2014 Jones Bartlett publishers, inc. Burlington. Massachusetts, USA, 2017.
- Molecular Biology of the Gene, Watson D. J. et al, 7th Ed, Pearson Ed, 2017.: Watson D. J. et al 2017 7th Ed, Pearson Ed, 2017.