Currículo

Modelação Molecular MMole

Contextos

Groupo: Despacho n.º 3505/2019 > 2º Ciclo > Componente Curricular > UCs Obrigatórias

ECTS

4.0 (para cálculo da média)

Objectivos

O objetivo desta unidade curricular consiste em colocar ao dispor do aluno um conjunto de metodologias e ferramentas computacionais que permitam criar e estimular um conhecimento base que este será capaz de aplicar corretamente em novas situações, nomeadamente em projetos de investigação na área da química farmacêutica e medicinal (e afins). É suposto que no final desta unidade o aluno seja capaz de propor um projeto original na área de formação do mestrado e executá-lo usando o conhecimento que adquiriu nesta unidade.

Programa

Este curso é uma introdução aos métodos de modelação molecular. Serão abordadas metodologias computacionais consideradas relevantes para a descoberta e desenvolvimento de novos agentes terapêuticos. O curso incidirá nos seguintes pontos: Introdução aos métodos de modelação; Importância da modelação molecular no desenho de novos fármacos; Visualização e construção de moléculas; Dinâmica e Mecânica Molecular; Docking Molecular e Screening Virtual; Mecânica Quântica; Métodos Combinados; Modelação de reações enzimáticas; Construção de farmacóforos; Modelação por Homologia. Novas metodologias.

Método de Avaliação

Ensino teórico: Este curso é uma introdução aos métodos de modelação molecular. Serão abordadas metodologias computacionais consideradas relevantes para a descoberta e desenvolvimento de novos agentes terapêuticos. O curso incidirá nos seguintes pontos: Introdução aos métodos de modelação; Importância da modelação molecular no desenho de novos fármacos; Visualização e construção de moléculas; Dinâmica e Mecânica Molecular; Docking Molecular e Screening Virtual; Mecânica Quântica; Métodos Combinados; Modelação de reações enzimáticas; Construção de farmacóforos; Modelação por Homologia. Aulas teóricas + Discussão de artigos + apresentações orais + respostas escritas a perguntas. Avaliação da Componente Teórica: Execução de uma monografia/Projeto. e apresentação oral. Ensino prático: Em todas as aulas serão executados tutoriais envolvendo as metodologias lecionadas nas aulas teóricas. Avaliação da Componente Prática: Execução de um projeto de investigação executado com metodologias desenvolvidas nas aulas Práticas. Avaliação Final = Classificação da componente teórica (50%) + Classificação da componente prática (50%)

Carga Horária

Carga Horária de Contacto -

Trabalho Autónomo - 82.0

Carga Total -

Bibliografia

Principal

Introduction to Computational Chemistry: Jensen, F. 2017 3rd Edition, John Wiley & Sons
Molecular Modelling: Principles and Applications: Leach, A. R. 2001 2nd Edition, Pearson
Computational medicinal chemistry for drug discovery: Bultinck, P., Tollenaere, J. P., Langenaeker, W., Winter, H. D., (Eds.), 2003 1st Edition, Marcel Dekker, 2003.
Molecular Modeling for Beginners: Hinchliffe, A., 2008 2nd Edition, John Wiley & Sons Inc, 2008.